22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0215 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  49.55 
 
 		 895 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  42.51 
 
 		 900 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  100 
 
 		 875 aa  1762    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  49.72 
 
 		 895 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  37.13 
 
 		 910 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  34.39 
 
 		 894 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  34.16 
 
 		 900 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  34.24 
 
 		 894 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3563  hypothetical protein  34.01 
 
 		 900 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  32.21 
 
 		 872 aa  436  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  24.34 
 
 		 856 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  23.03 
 
 		 809 aa  67.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  35.14 
 
 		 822 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  35.62 
 
 		 836 aa  54.3  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  23.95 
 
 		 841 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  24.17 
 
 		 841 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  24.17 
 
 		 841 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  28.24 
 
 		 822 aa  53.5  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  27.56 
 
 		 841 aa  45.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  27.56 
 
 		 841 aa  45.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 841 aa  45.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  27.56 
 
 		 841 aa  45.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>