19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0301 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  99.17 
 
 		 841 aa  1703    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  99.52 
 
 		 841 aa  1706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  99.05 
 
 		 841 aa  1702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  99.76 
 
 		 841 aa  1707    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  64.34 
 
 		 840 aa  1101    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  99.17 
 
 		 841 aa  1703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  99.76 
 
 		 841 aa  1707    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  26.37 
 
 		 822 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  26.85 
 
 		 836 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  25.3 
 
 		 856 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  23.34 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  23.36 
 
 		 809 aa  51.2  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  23 
 
 		 875 aa  48.5  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 977 aa  48.5  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  22.99 
 
 		 895 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  32.17 
 
 		 822 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01652  hypothetical protein  30.77 
 
 		 911 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2877  hypothetical protein  25.28 
 
 		 751 aa  45.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>