20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0036 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  100 
 
 		 872 aa  1779    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  31.4 
 
 		 900 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  32.09 
 
 		 875 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  32.43 
 
 		 895 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  31.95 
 
 		 895 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  30.73 
 
 		 900 aa  363  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  30.73 
 
 		 894 aa  363  9e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3563  hypothetical protein  30.65 
 
 		 900 aa  360  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  31.39 
 
 		 894 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  28.62 
 
 		 910 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  23.31 
 
 		 822 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  24.25 
 
 		 809 aa  60.1  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  23.22 
 
 		 841 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  23.22 
 
 		 841 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  23.22 
 
 		 841 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  24.65 
 
 		 822 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2877  hypothetical protein  21.29 
 
 		 751 aa  47.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  26.72 
 
 		 856 aa  47  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5212  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.55 
 
 		 760 aa  45.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  23.05 
 
 		 841 aa  45.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>