20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00250 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  99.17 
 
 
841 aa  1701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  100 
 
 
841 aa  1715    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  99.41 
 
 
841 aa  1704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  99.41 
 
 
841 aa  1707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  99.17 
 
 
841 aa  1701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  63.98 
 
 
840 aa  1096    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  99.17 
 
 
841 aa  1703    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  100 
 
 
841 aa  1715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  24.18 
 
 
856 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  26.37 
 
 
822 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  26.85 
 
 
836 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  23.22 
 
 
872 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  22.99 
 
 
895 aa  51.2  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  24.11 
 
 
875 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  22.31 
 
 
809 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2708  hypothetical protein  33.33 
 
 
977 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  32.17 
 
 
822 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  22.98 
 
 
895 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01652  hypothetical protein  30.77 
 
 
911 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2877  hypothetical protein  24.72 
 
 
751 aa  45.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>