14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3387 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  94.52 
 
 		 900 aa  1706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3563  hypothetical protein  94.97 
 
 		 900 aa  1716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  94.52 
 
 		 894 aa  1704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 894 aa  1831    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  34.56 
 
 		 900 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  34.39 
 
 		 875 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  33.18 
 
 		 895 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  32.92 
 
 		 895 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  30.41 
 
 		 910 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  31.5 
 
 		 872 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  24.04 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  28.03 
 
 		 836 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  22.15 
 
 		 856 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  32.56 
 
 		 822 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>