28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4570 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  41.28 
 
 		 836 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  100 
 
 		 856 aa  1757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  44.32 
 
 		 822 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  38.19 
 
 		 822 aa  612  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  24.1 
 
 		 875 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  23.44 
 
 		 840 aa  78.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 841 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  25.69 
 
 		 841 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  25.3 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  25.3 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  25.3 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  25.3 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  25.3 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  27.98 
 
 		 910 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  22.15 
 
 		 894 aa  52  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  34.25 
 
 		 895 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  34.25 
 
 		 895 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  24.26 
 
 		 833 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  24.26 
 
 		 833 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  24.2 
 
 		 850 aa  47.8  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  23.99 
 
 		 833 aa  47.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  20.63 
 
 		 900 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  27.13 
 
 		 894 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3964  hypothetical protein  41.79 
 
 		 771 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3657  hypothetical protein  41.79 
 
 		 777 aa  47  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  27.13 
 
 		 900 aa  47  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  26.72 
 
 		 872 aa  47  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0254  hypothetical protein  40.3 
 
 		 771 aa  45.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>