17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1504 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  64.22 
 
 		 841 aa  1077    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  63.98 
 
 		 841 aa  1093    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  63.86 
 
 		 841 aa  1071    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  63.98 
 
 		 841 aa  1093    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  64.22 
 
 		 841 aa  1077    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  100 
 
 		 840 aa  1718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  64.34 
 
 		 841 aa  1078    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  63.98 
 
 		 841 aa  1093    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  23.4 
 
 		 856 aa  92  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  25.73 
 
 		 822 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  23.08 
 
 		 836 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  22.39 
 
 		 809 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  22.1 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2877  hypothetical protein  36.9 
 
 		 751 aa  48.9  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5212  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.93 
 
 		 760 aa  47.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2708  hypothetical protein  26.9 
 
 		 977 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  28.26 
 
 		 875 aa  44.3  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>