13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3964 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0254  hypothetical protein  99.61 
 
 		 771 aa  1573    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3657  hypothetical protein  99.23 
 
 		 777 aa  1527    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3964  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1581    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2877  hypothetical protein  39.45 
 
 		 751 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5212  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.33 
 
 		 760 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  38.57 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0622  P pilus assembly protein porin PapC-like protein  26.22 
 
 		 948 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.563301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0590  P pilus assembly protein porin PapC-like protein  26.22 
 
 		 948 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0617  P pilus assembly protein porin PapC-like protein  26.22 
 
 		 948 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.309663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  26.15 
 
 		 910 aa  48.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  41.79 
 
 		 856 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  22.87 
 
 		 836 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  22.12 
 
 		 872 aa  44.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>