75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2664 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2664  TenA family transcription regulator  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3185  transcriptional activator, TenA family  94.88 
 
 		 215 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2531  TenA family transcription regulator  94.42 
 
 		 247 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2678  TenA family transcription regulator  87.79 
 
 		 215 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  68.72 
 
 		 213 aa  297  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  56.25 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6338  putative transcriptional activator, TenA family  47.85 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000818429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1301  TenA family transcriptional activator  45.24 
 
 		 225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  0.976947 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  41.04 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0685  transcriptional activator, TenA family  40.09 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45181  predicted protein  36.42 
 
 		 183 aa  131  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43079  predicted protein  29.73 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766897  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6167  transcriptional activator, TenA family  27.1 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  hitchhiker  0.00038061 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3694  putative transcription activator  26.48 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3429  TenA family transcription regulator  26.48 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.549237 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26735  predicted protein  30.23 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0740897  normal  0.77615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  21.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  23.83 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  23.83 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  23.83 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  26.07 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  28.96 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  27.75 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  27.75 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  19.16 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  26.73 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  27.23 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  24.02 
 
 		 561 aa  52.4  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  23.22 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  25.23 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  27.23 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  25.49 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  27.23 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  27.54 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  25.81 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  24.46 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  23 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  19.34 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  24.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  23.71 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  23.61 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  21.96 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  22.86 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  25.51 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  27.07 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  23.61 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  25.35 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  27.22 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  23.56 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  25 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  22.38 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  19.72 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  23.33 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  24.62 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0096  transcriptional activator, TenA family  30.93 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  42.11 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  24.26 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  22.4 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  33.8 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  42.55 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  19.72 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  24.5 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1517  TenA family transcription regulator  25.49 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5033  TenA family transcription regulator  28.46 
 
 		 207 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843073  normal  0.0290758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  19.91 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  26.79 
 
 		 234 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  24.06 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  21.88 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  24.72 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>