19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43079 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43079  predicted protein  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766897  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  34.09 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2678  TenA family transcription regulator  30.49 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2664  TenA family transcription regulator  29.73 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  29.19 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3185  transcriptional activator, TenA family  29.28 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2531  TenA family transcription regulator  28.83 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1301  TenA family transcriptional activator  32.21 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  0.976947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6338  putative transcriptional activator, TenA family  29.19 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000818429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0685  transcriptional activator, TenA family  27.75 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  27.03 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45181  predicted protein  26.4 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0300  TenA family transcription regulator  23.91 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  24.56 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0096  transcriptional activator, TenA family  22.27 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3694  putative transcription activator  17.83 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3429  TenA family transcription regulator  17.39 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.549237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  24.11 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  19.47 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>