67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2678 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2678  TenA family transcription regulator  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2664  TenA family transcription regulator  87.79 
 
 		 215 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2531  TenA family transcription regulator  87.32 
 
 		 247 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3185  transcriptional activator, TenA family  87.79 
 
 		 215 aa  348  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  66.82 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  56.46 
 
 		 220 aa  247  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6338  putative transcriptional activator, TenA family  47.37 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000818429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  43.87 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1301  TenA family transcriptional activator  46.19 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  0.976947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0685  transcriptional activator, TenA family  41.04 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45181  predicted protein  35.84 
 
 		 183 aa  128  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43079  predicted protein  30.49 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766897  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6167  transcriptional activator, TenA family  28.7 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  hitchhiker  0.00038061 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26735  predicted protein  32.08 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0740897  normal  0.77615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  21.96 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  26.54 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3429  TenA family transcription regulator  23.39 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.549237 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3694  putative transcription activator  24.66 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  20.91 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  26.46 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  26.46 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  26.46 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  21.86 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  21.86 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  21.86 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  23.72 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  24.34 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  23.26 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  24.77 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  21.86 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  25.23 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  21.86 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  21.86 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  21.86 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  21.86 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  26.91 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  21.55 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  23.47 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  26.27 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  23.66 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  23.74 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  25.35 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  24.3 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  23.33 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  25.77 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  19.27 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  24.55 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  20.09 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  25.23 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  19.63 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  19.89 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  20.09 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2909  transcriptional activator, TenA family  22.48 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  23.61 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  23.83 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  20.09 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  20.09 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  20.09 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  20.09 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  20.09 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5033  TenA family transcription regulator  27.69 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843073  normal  0.0290758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  28.64 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  20.28 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>