80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6167 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6167  transcriptional activator, TenA family  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  hitchhiker  0.00038061 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3694  putative transcription activator  52.36 
 
 
221 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3429  TenA family transcription regulator  51.89 
 
 
221 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.549237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0685  transcriptional activator, TenA family  31.66 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  34.87 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  30.77 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6338  putative transcriptional activator, TenA family  28.72 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000818429  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1301  TenA family transcriptional activator  29.9 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  0.976947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  29.65 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2531  TenA family transcription regulator  28.97 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3185  transcriptional activator, TenA family  28.97 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2678  TenA family transcription regulator  28.7 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2664  TenA family transcription regulator  27.1 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45181  predicted protein  24.34 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  24.49 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  23.22 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  23.22 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  23.22 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  23.47 
 
 
232 aa  58.2  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  20.93 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  26.4 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  22.34 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  23.47 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  23.08 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  22.12 
 
 
229 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  22.12 
 
 
229 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  22.12 
 
 
229 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  25.13 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  22.94 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  26.67 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  21.82 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  20.85 
 
 
231 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  25.36 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  20.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  20.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  20.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  20.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  20.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  20.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  25.76 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  21.15 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  21.82 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  26.83 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  22.96 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  22.97 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  23.74 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  19.39 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  28.04 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  23.53 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  20.2 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  24.29 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  20.43 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  19.81 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  19.91 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  19.81 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  19.81 
 
 
229 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  19.81 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  19.81 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  24.29 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  22.58 
 
 
518 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  19.34 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  21.83 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  18.78 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  19.72 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  20.66 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  19.34 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  19.34 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  25.39 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  22.27 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  20.85 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  19.34 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  19.34 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  25.39 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  25.39 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  22.67 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  21.88 
 
 
221 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  24.5 
 
 
232 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  24.87 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43079  predicted protein  25.64 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766897  normal  0.0273535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>