169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0278 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.02 
 
 		 513 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0239  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.21 
 
 		 514 aa  883    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0168  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.6 
 
 		 514 aa  891    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  92.2 
 
 		 513 aa  956    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730022  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05450  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.99 
 
 		 532 aa  829    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4959  phosphoenolpyruvate carboxykinase  97.08 
 
 		 513 aa  1005    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777018  hitchhiker  0.000506151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0117  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.6 
 
 		 513 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2657  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.29 
 
 		 527 aa  746    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.62 
 
 		 513 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.6 
 
 		 513 aa  715    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.21 
 
 		 513 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.08 
 
 		 513 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68580  phosphoenolpyruvate carboxykinase  88.69 
 
 		 513 aa  919    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.02 
 
 		 513 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.8 
 
 		 513 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0278  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 513 aa  1063    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3754  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.44 
 
 		 511 aa  772    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.62 
 
 		 513 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.62 
 
 		 513 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.02 
 
 		 520 aa  741    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.23 
 
 		 513 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0368  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.77 
 
 		 513 aa  891    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  99.81 
 
 		 513 aa  1062    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3504  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.02 
 
 		 518 aa  763    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5935  phosphoenolpyruvate carboxykinase  89.08 
 
 		 513 aa  920    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.62 
 
 		 513 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.75 
 
 		 513 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.54 
 
 		 513 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0140  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.54 
 
 		 513 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.82 
 
 		 513 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.92 
 
 		 517 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.72 
 
 		 517 aa  626  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.78 
 
 		 532 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.49 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.9 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.62 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.61 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 525 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.08 
 
 		 526 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.49 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.2 
 
 		 523 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.49 
 
 		 528 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.09 
 
 		 528 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.09 
 
 		 528 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.53 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.89 
 
 		 528 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.82 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.75 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 551 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.92 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.08 
 
 		 564 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.75 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.53 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.84 
 
 		 536 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.64 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.95 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.28 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.51 
 
 		 534 aa  457  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.46 
 
 		 536 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.27 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.48 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.48 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.96 
 
 		 529 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.26 
 
 		 537 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.63 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.84 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.84 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.65 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.4 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.05 
 
 		 528 aa  442  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.53 
 
 		 536 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.7 
 
 		 524 aa  444  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.67 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.67 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.67 
 
 		 536 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.17 
 
 		 537 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.38 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.6 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.81 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.56 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.21 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.66 
 
 		 561 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.44 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.12 
 
 		 536 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  41.8 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.83 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.58 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.97 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.07 
 
 		 534 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.81 
 
 		 537 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.38 
 
 		 532 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.85 
 
 		 537 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  44.77 
 
 		 537 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.07 
 
 		 538 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>