169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3623 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.86 
 
 		 520 aa  809    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.82 
 
 		 513 aa  906    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0239  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.42 
 
 		 514 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0168  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.23 
 
 		 514 aa  700    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.21 
 
 		 513 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730022  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0117  phosphoenolpyruvate carboxykinase  82.26 
 
 		 513 aa  880    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2657  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.61 
 
 		 527 aa  750    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05450  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.77 
 
 		 532 aa  713    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0278  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.62 
 
 		 513 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.02 
 
 		 513 aa  906    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.02 
 
 		 513 aa  905    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.69 
 
 		 513 aa  927    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68580  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.41 
 
 		 513 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.02 
 
 		 513 aa  905    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.96 
 
 		 513 aa  931    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.02 
 
 		 513 aa  907    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3754  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.08 
 
 		 511 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  86.74 
 
 		 513 aa  937    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.6 
 
 		 513 aa  911    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 513 aa  1065    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4959  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.41 
 
 		 513 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777018  hitchhiker  0.000506151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.21 
 
 		 513 aa  909    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0368  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.16 
 
 		 513 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.82 
 
 		 513 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3504  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.58 
 
 		 518 aa  720    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5935  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.19 
 
 		 513 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.41 
 
 		 513 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.65 
 
 		 517 aa  646    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.19 
 
 		 513 aa  926    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0140  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.41 
 
 		 513 aa  914    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.02 
 
 		 513 aa  906    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.45 
 
 		 517 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.11 
 
 		 528 aa  569  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.14 
 
 		 526 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.83 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.37 
 
 		 528 aa  559  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.58 
 
 		 523 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.52 
 
 		 528 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.52 
 
 		 528 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.32 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.13 
 
 		 528 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.32 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.32 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.32 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.32 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.32 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.26 
 
 		 525 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.76 
 
 		 526 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.94 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.75 
 
 		 532 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.01 
 
 		 499 aa  524  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.78 
 
 		 533 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.58 
 
 		 551 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.4 
 
 		 538 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.6 
 
 		 530 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.78 
 
 		 536 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.4 
 
 		 536 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.81 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.69 
 
 		 572 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.7 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.88 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.23 
 
 		 529 aa  497  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.29 
 
 		 564 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.7 
 
 		 536 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.09 
 
 		 536 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.51 
 
 		 530 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.52 
 
 		 532 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.3 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.2 
 
 		 536 aa  475  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.83 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 561 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.38 
 
 		 530 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.32 
 
 		 537 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.98 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.75 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.64 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.88 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.49 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.84 
 
 		 524 aa  475  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.99 
 
 		 525 aa  475  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.64 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.89 
 
 		 539 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.76 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.53 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.12 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.79 
 
 		 538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.71 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.44 
 
 		 536 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.62 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.03 
 
 		 558 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.71 
 
 		 532 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.82 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.66 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.65 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.39 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.5 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>