170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3504 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.86 
 
 
513 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0239  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.67 
 
 
514 aa  757    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0168  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.48 
 
 
514 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.73 
 
 
513 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730022  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0278  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.23 
 
 
513 aa  743    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650878  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0117  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.05 
 
 
513 aa  713    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2657  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.47 
 
 
527 aa  750    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4959  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.62 
 
 
513 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777018  hitchhiker  0.000506151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0148  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.86 
 
 
513 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.86 
 
 
513 aa  698    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.86 
 
 
513 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0101  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.16 
 
 
513 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68580  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.91 
 
 
513 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.06 
 
 
513 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.03 
 
 
513 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3754  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.33 
 
 
511 aa  780    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.06 
 
 
513 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.58 
 
 
513 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3571  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.86 
 
 
513 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0368  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.73 
 
 
513 aa  737    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0268  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.43 
 
 
513 aa  744    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3504  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
518 aa  1074    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5935  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.5 
 
 
513 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.06 
 
 
513 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05450  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.24 
 
 
532 aa  748    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251652  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2191  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.18 
 
 
517 aa  652    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.44 
 
 
520 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.76 
 
 
513 aa  698    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.46 
 
 
513 aa  710    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0140  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.73 
 
 
513 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0149  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.25 
 
 
513 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2217  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.78 
 
 
517 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.12 
 
 
528 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.31 
 
 
528 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.87 
 
 
513 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.15 
 
 
532 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.92 
 
 
528 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.26 
 
 
526 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.92 
 
 
528 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.92 
 
 
528 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.73 
 
 
528 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.73 
 
 
528 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.73 
 
 
528 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.73 
 
 
528 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.73 
 
 
528 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.53 
 
 
528 aa  521  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.07 
 
 
525 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.86 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.67 
 
 
523 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.57 
 
 
551 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.02 
 
 
533 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 
538 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 
526 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.21 
 
 
530 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.21 
 
 
530 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.1 
 
 
499 aa  488  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.46 
 
 
530 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.73 
 
 
572 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.64 
 
 
529 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.37 
 
 
571 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.37 
 
 
571 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.39 
 
 
530 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.32 
 
 
564 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.34 
 
 
532 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 
536 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.64 
 
 
536 aa  464  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.53 
 
 
536 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.27 
 
 
532 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.27 
 
 
532 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.77 
 
 
534 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.92 
 
 
536 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.08 
 
 
536 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.13 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.36 
 
 
532 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.38 
 
 
537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.69 
 
 
536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.78 
 
 
532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.28 
 
 
534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.38 
 
 
537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.37 
 
 
538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.06 
 
 
561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.78 
 
 
532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.44 
 
 
536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.58 
 
 
537 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.98 
 
 
558 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.83 
 
 
536 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.08 
 
 
536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.69 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.81 
 
 
524 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.39 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.38 
 
 
537 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.11 
 
 
530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.63 
 
 
537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.45 
 
 
533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.67 
 
 
529 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.65 
 
 
537 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.71 
 
 
525 aa  444  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.62 
 
 
524 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.7 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>