102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1461 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1461  molybdenum-binding protein  100 
 
 		 124 aa  247  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 270 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.3 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  44.74 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  37.35 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  45.57 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  43.06 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  48.21 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  41.18 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  45.21 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  48.08 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  39.19 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  48.08 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  42.47 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  43.21 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.28 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  43.66 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  36.99 
 
 		 263 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 268 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.71 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  51.02 
 
 		 278 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  35.56 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  38.81 
 
 		 270 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 290 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  36.84 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  46.94 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  38.03 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.29 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  35.29 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  33.78 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 278 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 279 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 278 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 274 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 266 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  46.81 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 254 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 281 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 281 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  46.81 
 
 		 252 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 254 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 279 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  32.88 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  37.66 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  42.86 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  40.82 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  36.11 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  40.82 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  37.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 254 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  32.47 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  40 
 
 		 260 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 263 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  51.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  47.06 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 108 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.25 
 
 		 262 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  34.72 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2469  putative transcriptional regulator, ModE family  36 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  34.25 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>