241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2482 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  49.62 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  52.92 
 
 
272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  45.34 
 
 
261 aa  219  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  44.96 
 
 
277 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  44.02 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  42.41 
 
 
264 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  36.61 
 
 
245 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  38.65 
 
 
249 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  40.26 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  38.08 
 
 
241 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  36.76 
 
 
262 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  37.3 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.98 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  37.55 
 
 
245 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  37.4 
 
 
238 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  33.07 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  39.13 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  34.8 
 
 
236 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  34.8 
 
 
236 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  38.7 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  34.69 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  34.12 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  33.59 
 
 
265 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  37.24 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 
240 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  39.3 
 
 
243 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  33.6 
 
 
240 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  35.48 
 
 
242 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  31.87 
 
 
252 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  38.16 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
240 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.66 
 
 
241 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  34.05 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  31.92 
 
 
241 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  32.26 
 
 
241 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
243 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  34.2 
 
 
243 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31.93 
 
 
232 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  34.76 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 
251 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  31.09 
 
 
239 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  31.46 
 
 
373 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  35.96 
 
 
245 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  31.78 
 
 
246 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
242 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  31.6 
 
 
235 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  31.06 
 
 
232 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  31.25 
 
 
276 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  31.33 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  29.64 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  37 
 
 
221 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  31.8 
 
 
238 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  31.58 
 
 
240 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  33.82 
 
 
225 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  31.45 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  33.79 
 
 
233 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  29.1 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  29.62 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  30.19 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  35.75 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  30.61 
 
 
237 aa  92.8  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  34.91 
 
 
239 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
236 aa  92.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
236 aa  92.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  30.87 
 
 
248 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
429 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  28.51 
 
 
238 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  29.88 
 
 
228 aa  89.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  29.02 
 
 
245 aa  89.4  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  28.51 
 
 
238 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  37.22 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  36.31 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.53 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  37.13 
 
 
240 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  31.14 
 
 
241 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  28.76 
 
 
214 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  29.2 
 
 
244 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
265 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
232 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  29.81 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  29.89 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  30.89 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  27.8 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  27.43 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  32.09 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0458  6-phosphogluconolactonase  28.69 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  32.73 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  35.11 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  35.29 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  35.54 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  31.22 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  26.29 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>