289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2121 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  52.94 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  48.9 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  47.22 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  47.22 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  49.76 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  46.85 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  46.85 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  45.27 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  44.17 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  41.28 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  40.6 
 
 		 262 aa  134  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  39.59 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  43.06 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  39.11 
 
 		 240 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  36.17 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  43.16 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  37.75 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  35.04 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  34.55 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  41.26 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  37.83 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  42.25 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  36.44 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  38.68 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  38.68 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  38.68 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  32.91 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  35.42 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  40.59 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  36.59 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  37.07 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  35.8 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  37.07 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  33.08 
 
 		 373 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  40.25 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  37.6 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  36.59 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  38.37 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.91 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  32.2 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.34 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  34.08 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  36.51 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  38.21 
 
 		 258 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  32.77 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  30.51 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  34.48 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  35.29 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  31.58 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  37.96 
 
 		 494 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.08 
 
 		 245 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  37.76 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  39.53 
 
 		 571 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  35.9 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  34.15 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  36.12 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  37.76 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.66 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  34.98 
 
 		 429 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  34.95 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  31.49 
 
 		 264 aa  94.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  29.46 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  40.11 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  36.86 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2526  6-phosphogluconolactonase  34.8 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  30.67 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  34.33 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.27 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  34.1 
 
 		 447 aa  92  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  35.84 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  30.67 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  38.81 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  38.63 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2071  6-phosphogluconolactonase  35.65 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  40.78 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  37.39 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  32.87 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  32.22 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  30.38 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.6 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  29.88 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  38.76 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  32.45 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>