275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003324 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  92.83 
 
 
238 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  80.25 
 
 
238 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  73.11 
 
 
240 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  58.37 
 
 
244 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  57.48 
 
 
214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  35.42 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  40.48 
 
 
242 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  39.29 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  38.02 
 
 
242 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
252 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  35.58 
 
 
245 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
232 aa  131  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  38.03 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 
239 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.98 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  34.05 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  32.8 
 
 
245 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  34.15 
 
 
241 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 
239 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  37.25 
 
 
241 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  37.11 
 
 
243 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  37.63 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  36.2 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  34.89 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 
236 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  34.57 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  34.12 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  36.28 
 
 
262 aa  118  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  33.95 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  34.4 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  32.35 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  34.13 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  33.94 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  33.64 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
271 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  39.66 
 
 
243 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  36.82 
 
 
240 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  33.18 
 
 
243 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  33.94 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  33.98 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  33.79 
 
 
235 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  33.79 
 
 
235 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  30.57 
 
 
264 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  33.81 
 
 
240 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  30.18 
 
 
494 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  33.17 
 
 
248 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  31.76 
 
 
373 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  32.37 
 
 
250 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  32.39 
 
 
251 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  32.59 
 
 
242 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  30.81 
 
 
261 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  33.06 
 
 
237 aa  101  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  32.77 
 
 
228 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
245 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  32.19 
 
 
248 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  29.03 
 
 
220 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  33.17 
 
 
241 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  31.19 
 
 
248 aa  99  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  32.7 
 
 
239 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  31.92 
 
 
249 aa  99  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  31.84 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  33.82 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  29.76 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 
429 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  28.89 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  34.97 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  34.74 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  32.08 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  30.66 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  39.01 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  30.57 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  34 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  32.43 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  32.41 
 
 
260 aa  92  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  38.24 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.38 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  30.9 
 
 
294 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  29.41 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  32.06 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  29.2 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  33.94 
 
 
571 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  34.52 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  34.52 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  30.81 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  34.25 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  31.39 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  28.51 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  28.51 
 
 
303 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  32.84 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  30.2 
 
 
232 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.99 
 
 
236 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.33 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  30.26 
 
 
274 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.06 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>