254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4158 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  77.59 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  75 
 
 		 248 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  66.95 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  59.92 
 
 		 429 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  63 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  63.2 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  53.02 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  55.5 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  52.66 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  52.63 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  54.26 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  53.2 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  43.04 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  41.7 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  48.74 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  41.43 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  39.42 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  40.58 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  38.56 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  39.19 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  41.46 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  40.49 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  38.65 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  41.43 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  38.65 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  40.74 
 
 		 494 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  35.93 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  38.65 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.03 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  38.35 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  39.05 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  39.32 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  34.27 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  36.29 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  36.17 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  34.39 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  32.52 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  35.53 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  42.19 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  37.83 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.14 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  37.68 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  32.61 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  37.68 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  37.78 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  34.65 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  32.24 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  35.51 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  33.68 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  37.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  37.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  37.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.821995 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  34.98 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  44.57 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  29.61 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  37.08 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  42.16 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  32.89 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.3 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  36.33 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  39.8 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  33.04 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  31.3 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  29.1 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  36.06 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  34.62 
 
 		 214 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  36.63 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  39.01 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  33.74 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  37.92 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  36.84 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  35.42 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  35.11 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  34.16 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.7 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  38.63 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  35.11 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.05 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  34.75 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  34.66 
 
 		 294 aa  89.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  30.58 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  34.26 
 
 		 317 aa  88.6  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  39.78 
 
 		 447 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>