268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4827 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
243 aa  487  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  97.12 
 
 
243 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  88.07 
 
 
243 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  67.63 
 
 
241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  61.3 
 
 
240 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  61 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  52.59 
 
 
242 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  53.59 
 
 
429 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  52.81 
 
 
248 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  52.61 
 
 
246 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  49.77 
 
 
241 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  49.78 
 
 
248 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  49.57 
 
 
235 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  50 
 
 
251 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  49.52 
 
 
240 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  42.55 
 
 
245 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  44.3 
 
 
245 aa  165  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  39.68 
 
 
252 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  42.37 
 
 
248 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  42.86 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  39.35 
 
 
239 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  38.17 
 
 
242 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  41.15 
 
 
262 aa  148  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  38.76 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  46.05 
 
 
242 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  37.07 
 
 
241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  47.69 
 
 
243 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  48.15 
 
 
243 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  39.5 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  36.84 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  35.95 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  41.08 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  38.28 
 
 
236 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  38.68 
 
 
240 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  38.28 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  47.59 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  36.21 
 
 
238 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  39.91 
 
 
237 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  44.83 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  37.66 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  40.18 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  34.3 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  33.18 
 
 
238 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  41.56 
 
 
249 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 
264 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  34.09 
 
 
220 aa  121  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  35.48 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  38.25 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  30.87 
 
 
241 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  32.64 
 
 
238 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  33.06 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31.6 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  36 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  36 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  31.58 
 
 
244 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  37.17 
 
 
265 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  34.16 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 
252 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
245 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  35.83 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 
272 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  33.46 
 
 
373 aa  112  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 
246 aa  111  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  34.58 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  34.12 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.18 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  30.58 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.94 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.02 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  37.05 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.23 
 
 
244 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  38.83 
 
 
233 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  31.47 
 
 
265 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 
218 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  37.61 
 
 
232 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  31.98 
 
 
260 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
261 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  34.91 
 
 
247 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
238 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  35.15 
 
 
232 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  35.48 
 
 
245 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
214 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  35.48 
 
 
245 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  35.48 
 
 
245 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  34.52 
 
 
241 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  34.32 
 
 
294 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 
246 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
279 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  35.35 
 
 
494 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
225 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  32.74 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
248 aa  98.2  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  31.38 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  34.01 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  31.65 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>