More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2618 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
241 aa  487  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  55.23 
 
 
248 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  47.92 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  44.21 
 
 
241 aa  210  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  45.22 
 
 
241 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  42.67 
 
 
239 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  54.72 
 
 
242 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  42.8 
 
 
238 aa  191  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  42.15 
 
 
239 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  45.15 
 
 
238 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  44.89 
 
 
245 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  44.73 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  43.1 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  42.06 
 
 
240 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  41.42 
 
 
236 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  41.6 
 
 
236 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  42.8 
 
 
242 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  46.03 
 
 
262 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  42.56 
 
 
240 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  39.15 
 
 
240 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  42.02 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  51.67 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  41.7 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  42.44 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  51.67 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  41.35 
 
 
248 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  39.06 
 
 
277 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  38.36 
 
 
241 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  42.86 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  43.27 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  41.45 
 
 
271 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  38.49 
 
 
241 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  41.9 
 
 
243 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  42.15 
 
 
243 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  54.19 
 
 
243 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  38.28 
 
 
279 aa  148  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  34.58 
 
 
238 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.58 
 
 
238 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  36.17 
 
 
237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  39.15 
 
 
272 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 
241 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  41.43 
 
 
246 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  40.66 
 
 
256 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  43.13 
 
 
239 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  40.25 
 
 
246 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  37.25 
 
 
303 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  39.13 
 
 
237 aa  141  7e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  42.19 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 
244 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  36.13 
 
 
429 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  40.49 
 
 
233 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 
235 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 
235 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  36.68 
 
 
245 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  39.5 
 
 
242 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  37.55 
 
 
236 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  39.81 
 
 
235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.99 
 
 
264 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  39.34 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  42.28 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  42.31 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  39.67 
 
 
248 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  35.89 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  37.96 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  37.66 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  39.04 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  37.3 
 
 
261 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.5 
 
 
245 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  35.24 
 
 
214 aa  125  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  32.21 
 
 
240 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  38.39 
 
 
248 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  37.76 
 
 
256 aa  121  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  35.19 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  37.61 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  34.8 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.46 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  34.43 
 
 
257 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  31.06 
 
 
373 aa  119  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  30.83 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.29 
 
 
245 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  39.62 
 
 
494 aa  118  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  33.95 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  35.21 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  33.6 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  40.8 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  34.17 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  34.51 
 
 
317 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  32.44 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  32.47 
 
 
294 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  40.28 
 
 
271 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  35.59 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  35.66 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  35.66 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  35.66 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  38.71 
 
 
243 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  36.12 
 
 
265 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>