246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2071 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  48.77 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  42.44 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  43.28 
 
 
235 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  43.28 
 
 
235 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  44.17 
 
 
228 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  47.22 
 
 
236 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  47.22 
 
 
236 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  42.47 
 
 
237 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  41.13 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  37.13 
 
 
262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  39.7 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  42.42 
 
 
252 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  42.7 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  39.89 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.5 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  34.52 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  34.34 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  42.35 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  38.5 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  35.79 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  38.05 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  37.36 
 
 
241 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  38.86 
 
 
248 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  41.28 
 
 
242 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  35.25 
 
 
241 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  38.15 
 
 
220 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.58 
 
 
248 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  37.37 
 
 
218 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  30.96 
 
 
236 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  30.96 
 
 
236 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  38.75 
 
 
239 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  33.67 
 
 
245 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  30.65 
 
 
240 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  37.17 
 
 
225 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  37.91 
 
 
249 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  39.13 
 
 
494 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  35.35 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  39.74 
 
 
258 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  30.46 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 
257 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  35.33 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  32.88 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  34.01 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  35.4 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  30.5 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  32.67 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  30.77 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
272 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  34.25 
 
 
277 aa  93.2  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  35.67 
 
 
271 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  34.25 
 
 
241 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  30.53 
 
 
246 aa  92  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  32.1 
 
 
249 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  37.58 
 
 
257 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  35.62 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  31.5 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  37.84 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  31.37 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  35.79 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  32.77 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  36.07 
 
 
262 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1894  6-phosphogluconolactonase  38.36 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  38.66 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  41.62 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  34.07 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  33.15 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  32.99 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  29.39 
 
 
279 aa  88.6  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  32.17 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  34.16 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  32.71 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  29.96 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  29.63 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  31.22 
 
 
271 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  32.5 
 
 
238 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  27.78 
 
 
244 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  30.77 
 
 
246 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  39.77 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  36.72 
 
 
429 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  31.79 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  31.53 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  31.61 
 
 
237 aa  85.1  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  36.49 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  33.67 
 
 
261 aa  85.1  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  36.18 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  30.39 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  29.56 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  33 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  39.88 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  29.15 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.93 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>