235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2970 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  51.1 
 
 
235 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  51.1 
 
 
235 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  50.67 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  45.89 
 
 
232 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  49.76 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  49.07 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  49.07 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  45.75 
 
 
225 aa  176  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  45.83 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  40.21 
 
 
262 aa  125  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  36.32 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  35.29 
 
 
238 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
242 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  38.74 
 
 
241 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  33.94 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  34.29 
 
 
240 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  36.82 
 
 
241 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  30.4 
 
 
241 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  30.45 
 
 
232 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  34.83 
 
 
241 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  41.34 
 
 
218 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  37.24 
 
 
241 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
239 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  35.91 
 
 
235 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  32.65 
 
 
244 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  30.81 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  32.85 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  32.85 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  35.92 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  36.63 
 
 
242 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  30.53 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  29.11 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  32.2 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  34.69 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  36.41 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  31.1 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  31.44 
 
 
214 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  30.2 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  37.71 
 
 
221 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  37.64 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  35.83 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  33.67 
 
 
238 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  34.4 
 
 
248 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  32.84 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  32.84 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  37.37 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  32.84 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  34.98 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  34.41 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  27.19 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  29.46 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  31.19 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  30.8 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  36.31 
 
 
247 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  33.71 
 
 
220 aa  92  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
254 aa  92  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  34.62 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  37.93 
 
 
494 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  39.09 
 
 
429 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  32.74 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  29.07 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  28.63 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  30.08 
 
 
248 aa  89  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  34.62 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  37.89 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  31.71 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  29.15 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  34.15 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  36.76 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  30.91 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  33.16 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  25.75 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0458  6-phosphogluconolactonase  30.65 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  36.56 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  29.65 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  28.63 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
447 aa  85.5  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  35.38 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  31.46 
 
 
260 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  34.95 
 
 
251 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  31.74 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  30.58 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  34.78 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  28 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  29.53 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  28.39 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  36.61 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  33.72 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  28.44 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.12 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  34.31 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  34.48 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  34.05 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  33.98 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  26.21 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  27.97 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  27.04 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>