251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1645 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2071  6-phosphogluconolactonase  70.93 
 
 
257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  57.14 
 
 
261 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  54.44 
 
 
257 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  56.98 
 
 
259 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  52.49 
 
 
256 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  56.92 
 
 
258 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  51.87 
 
 
260 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  49.64 
 
 
272 aa  245  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  54.75 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  49.28 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  52.87 
 
 
256 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  52.09 
 
 
254 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  49.6 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  52.09 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  50.59 
 
 
248 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  52.27 
 
 
494 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  56.09 
 
 
447 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  46.54 
 
 
248 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2257  6-phosphogluconolactonase  46.95 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  44.27 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  44.87 
 
 
241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  47.41 
 
 
245 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  47.41 
 
 
245 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  47.41 
 
 
245 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2526  6-phosphogluconolactonase  47.48 
 
 
254 aa  185  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  52.74 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  46.48 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  49.41 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  49.36 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  50.4 
 
 
249 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  48.25 
 
 
244 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  42.97 
 
 
246 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 
274 aa  149  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  37.36 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
245 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.73 
 
 
239 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 
238 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  31.03 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.43 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  38.16 
 
 
571 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  30.22 
 
 
242 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  34.26 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.32 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  34.26 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  31.62 
 
 
248 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  34.94 
 
 
262 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13160  6-phosphogluconolactonase  35.69 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  39.15 
 
 
240 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  36.12 
 
 
241 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  32.4 
 
 
271 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  31.5 
 
 
249 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  37.89 
 
 
235 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  33.06 
 
 
240 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  31.86 
 
 
246 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  32.17 
 
 
245 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  32 
 
 
277 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  39.22 
 
 
242 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  29.84 
 
 
241 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  31.1 
 
 
252 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  29.24 
 
 
373 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  35.63 
 
 
245 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  32.64 
 
 
240 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  30.49 
 
 
279 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  32.82 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  36.2 
 
 
225 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  36.12 
 
 
228 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  36.92 
 
 
429 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  27.52 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  36.21 
 
 
251 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  31.23 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  34.77 
 
 
242 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  27.97 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  33.64 
 
 
232 aa  92.8  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  33.18 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  38.05 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  38.05 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  30.67 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  29.06 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  35.79 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  30.89 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  28.04 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  30.51 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  28.99 
 
 
260 aa  89.7  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  34.36 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  35.03 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  35.03 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  30.6 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  37.24 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  39.18 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  26.09 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>