57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1647 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1647  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 63 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.208039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  56.25 
 
 		 228 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  61.54 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  61.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  61.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  61.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  61.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  61.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  61.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  64.86 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  50 
 
 		 233 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 247 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  54.35 
 
 		 240 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  51.22 
 
 		 227 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  59.46 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  49.02 
 
 		 240 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  50 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  48.89 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 261 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  41.86 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  44.68 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0088  hypothetical protein  40.82 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0780431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 259 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  52.78 
 
 		 118 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  46 
 
 		 238 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 		 248 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  46.15 
 
 		 262 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  45 
 
 		 232 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  52.38 
 
 		 240 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  47.73 
 
 		 261 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.04 
 
 		 296 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  52.63 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  54.84 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  53.66 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  52.38 
 
 		 279 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 247 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  42 
 
 		 242 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  40.38 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  47.22 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 260 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  47.22 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.13 
 
 		 243 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>