More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1209 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 678 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2806  methionyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 688 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 722 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1586  methionyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 733 aa  697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 		 694 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  71.56 
 
 		 688 aa  867    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 692 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 711 aa  857    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 716 aa  858    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 679 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1161  methionyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 697 aa  698    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.639478 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 725 aa  857    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 696 aa  771    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 688 aa  859    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  70.89 
 
 		 720 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 690 aa  737    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 		 725 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 674 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1843  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 717 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.108651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  71.09 
 
 		 720 aa  855    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 680 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1936  methionyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 728 aa  704    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547314  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0647  methionyl-tRNA synthetase  93.35 
 
 		 556 aa  1095    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 770 aa  855    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  71.92 
 
 		 710 aa  873    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  71.2 
 
 		 726 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 688 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3275  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 700 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  64.38 
 
 		 692 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  64.38 
 
 		 692 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0924  methionyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 		 689 aa  695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  71.61 
 
 		 710 aa  859    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2056  methionyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 689 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.566745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 681 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  71.25 
 
 		 690 aa  855    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 685 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4081  methionyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 704 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 718 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1209  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 556 aa  1161    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000377158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 717 aa  856    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2758  methionyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 689 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 717 aa  856    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 675 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 683 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  70.89 
 
 		 720 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 673 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 717 aa  856    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 718 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 		 717 aa  855    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  71.74 
 
 		 709 aa  871    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 725 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 675 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 680 aa  680    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 678 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3834  methionyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 706 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0818  methionyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 707 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3483  methionyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 688 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 676 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 689 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4480  methionyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 691 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 689 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 689 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 678 aa  628  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 676 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 676 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 689 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 689 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 676 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 683 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 675 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 681 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 679 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19050  methionyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 678 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.153863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 677 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 677 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 675 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 670 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1644  methionyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 679 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  53.31 
 
 		 677 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 677 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 677 aa  623  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 677 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 700 aa  623  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 677 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 678 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 677 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 677 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 678 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 678 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 677 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 676 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 682 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 677 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 680 aa  620  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 682 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 731 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1709  methionyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>