45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4476 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4476  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  186  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.922582  hitchhiker  0.00000000138128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  57.14 
 
 		 1361 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.05 
 
 		 1391 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  52.78 
 
 		 1407 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.35 
 
 		 1297 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.63 
 
 		 889 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.14 
 
 		 1223 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 488 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.46 
 
 		 581 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 660 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  53.06 
 
 		 755 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 		 781 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  47.22 
 
 		 1371 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  50 
 
 		 1399 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 581 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.94 
 
 		 1287 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 1255 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 1002 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  52.63 
 
 		 1220 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  54.29 
 
 		 1384 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.35 
 
 		 606 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4375  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 550 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  58.14 
 
 		 580 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 		 1084 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 		 473 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 		 866 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 		 1431 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 582 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 530 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 584 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 1068 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 416 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 530 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 796 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 938 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  54.29 
 
 		 1015 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 799 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  47.92 
 
 		 547 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 955 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 701 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4666  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 578 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  36.92 
 
 		 659 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  52.78 
 
 		 518 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 1048 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.29 
 
 		 770 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>