More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0178 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0178  ribosomal protein L19  100 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 116 aa  137  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 116 aa  137  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  59.8 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  57.94 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  57.8 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 158 aa  126  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0698  ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000127437  hitchhiker  0.00000355367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  50.86 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  54.7 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  52.73 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  52.73 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  50.91 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1533  ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121036  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  53.51 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  50.91 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  58 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  50.45 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  56.19 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  55.24 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>