More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1533 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1533  ribosomal protein L19  100 
 
 
118 aa  230  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121036  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 
118 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 
118 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  64.29 
 
 
124 aa  148  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 
118 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  67.29 
 
 
119 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  66.97 
 
 
113 aa  147  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 
114 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  61.21 
 
 
116 aa  146  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  61.61 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  64.22 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 
120 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 
158 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 
118 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 
115 aa  144  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 
120 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.71 
 
 
116 aa  143  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
115 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
156 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 
117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
118 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 
137 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
159 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
158 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
127 aa  142  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 
177 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 
162 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
162 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 
115 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 
116 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 
116 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  63.39 
 
 
124 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
121 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 
156 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 
130 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  61.61 
 
 
119 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
115 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
114 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 
116 aa  141  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  62.07 
 
 
119 aa  140  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 
114 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 
120 aa  140  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
180 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 
128 aa  140  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  58.41 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  56.41 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
183 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
115 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  54.78 
 
 
117 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  63.3 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 
166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  59.63 
 
 
113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
184 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
118 aa  137  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
115 aa  137  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
120 aa  136  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  60 
 
 
163 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
134 aa  135  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  59.65 
 
 
114 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
116 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
119 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
134 aa  135  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
117 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  55.46 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
117 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  58.77 
 
 
120 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
115 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
115 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>