69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1484 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  46.29 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45.98 
 
 		 239 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  45.54 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  46.88 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  47.64 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  44.17 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.21 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.01 
 
 		 230 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  42.35 
 
 		 230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  39.41 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  32.89 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  37.93 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  37.29 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  37.93 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  34.76 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  38.86 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  34.29 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  39.89 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  33.81 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  42.79 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  39.34 
 
 		 242 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  42.86 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  38.24 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  43.6 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  43.6 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  39.89 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  42.35 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  36.41 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  39.9 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  37.09 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  42.7 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.09 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.51 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2538  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.93 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000122847  hitchhiker  0.00117783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.78 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1907  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.74 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1899  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25.1 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2737  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  39.08 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0480809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2743  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.73 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1498  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  28.73 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.809712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1098  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.99 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1987  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.73 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.19 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  28.26 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0896  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  28.26 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0183  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.57 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0988  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.27 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0459  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.73 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2011  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.57 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.91 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2273  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.31 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2198  archaetidylserine synthase  29.01 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000939718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3716  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.94 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00732848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3495  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.47 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000947375  hitchhiker  0.00194912 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.15 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  35.21 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.88 
 
 		 186 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  38.03 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0515  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.12 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3325  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.71 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5066  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  28.26 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.426955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3506  phosphatidylserine synthase (CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase)  27.1 
 
 		 296 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>