41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  98.31 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  78.07 
 
 		 254 aa  338  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  67.69 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  67.25 
 
 		 239 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  66.09 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  44.17 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  44.19 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  41.15 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  42.93 
 
 		 287 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  39.15 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.51 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  41.71 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  41.85 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  40.1 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  42.16 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.71 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  42.93 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  40.59 
 
 		 244 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  43.33 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  43.33 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  37.1 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  43.35 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.01 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  34.57 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.65 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  40.61 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  42.02 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  39.32 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.14 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  38.29 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  29.78 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  29.33 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.71 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.23 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  31.71 
 
 		 177 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2826  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.3 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  29.81 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.77 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.245577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2737  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  27.66 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0480809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>