47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0497 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  93.1 
 
 		 238 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  93.1 
 
 		 238 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  73.04 
 
 		 230 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  68.56 
 
 		 230 aa  324  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  60.7 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  46.19 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  45.61 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  44.25 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  44.25 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  43.42 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  42.79 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  41.05 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  41.05 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.23 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  41.2 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  45.79 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  47 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  45.16 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  43.16 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.16 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  47.59 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  40.99 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  46 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  42.16 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  43.32 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  41.45 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  40.11 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  41.62 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  29.91 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  34.86 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  26.43 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  27.63 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2273  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.06 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.6 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0691  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.59 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1263  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.87 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0298141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  24.83 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0896  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  26.6 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.6 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4661  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.99 
 
 		 275 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.141457 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1132  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.47 
 
 		 242 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.98 
 
 		 315 aa  41.6  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1257  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.47 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>