59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1029 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  58.15 
 
 
230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  60.7 
 
 
232 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  60.26 
 
 
238 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  60.26 
 
 
238 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  54.19 
 
 
230 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  41.48 
 
 
253 aa  180  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  40 
 
 
247 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.72 
 
 
243 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  43.98 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  41.33 
 
 
244 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.91 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.19 
 
 
244 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  37.9 
 
 
287 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  37.33 
 
 
270 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  39.91 
 
 
241 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  37.33 
 
 
266 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  41.03 
 
 
244 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  38.36 
 
 
242 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  42.41 
 
 
244 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  38.25 
 
 
241 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  37.9 
 
 
242 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.67 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  38.71 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.71 
 
 
239 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  40.1 
 
 
254 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  39.78 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.18 
 
 
254 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  39.9 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.62 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  29.95 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  38.71 
 
 
238 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  33.33 
 
 
236 aa  95.5  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0515  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.46 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2273  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.62 
 
 
248 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3167  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.09 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000318686  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3070  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.09 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000697512  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3575  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, putative  31.09 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2989  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.09 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505738  normal  0.32761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01448  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, putative  31.09 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1627  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  28.65 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1263  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.39 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0298141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3072  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.39 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2776  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.03 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2600  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.15 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000101505  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.44 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3495  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.41 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000947375  hitchhiker  0.00194912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2945  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.25 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000877999  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  29.63 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0610  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.53 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3718  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.41 
 
 
260 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000542446  hitchhiker  0.00889644 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.25 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2686  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.48 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0505612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0691  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.69 
 
 
249 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1759  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  32.91 
 
 
244 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1340  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.41 
 
 
274 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00208453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  28 
 
 
177 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>