46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3554 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  77.63 
 
 		 236 aa  357  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  78.07 
 
 		 238 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  66.09 
 
 		 249 aa  318  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  65.64 
 
 		 239 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  65.2 
 
 		 239 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  46.55 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  44.15 
 
 		 287 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  45.9 
 
 		 230 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  42.79 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  43.62 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  42.39 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  37.5 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  43.62 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.38 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  37.07 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  47.06 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  47.06 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  45.88 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  36.13 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  40.91 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  41.62 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  35.62 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.01 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  41.12 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.02 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  40.91 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  40.11 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  38.15 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  36.18 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  43.42 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  32.05 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  31.62 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.53 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.78 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0988  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  28.33 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1098  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.63 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  25.95 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1031  hypothetical protein  25.58 
 
 		 172 aa  45.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.245577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2463  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  27.89 
 
 		 179 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0584  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.85 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0606  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.85 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0593  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.85 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>