57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2093 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  79.83 
 
 		 239 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  79.83 
 
 		 239 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  66.95 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  66.09 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  66.09 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  46.88 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  44.44 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  38.33 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  37.89 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  37.89 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  45.25 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  37.81 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  44.81 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.81 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  38.57 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.45 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  37.25 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  36.76 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  38.5 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.13 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  36.76 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  40.74 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  38.27 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  36.52 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  37.5 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  35.59 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.67 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  36.45 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  36.24 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  31.98 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  27.9 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  27.47 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.75 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1059  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.78 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0885  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2273  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.3 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.74 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000985614  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1899  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  26.22 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0988  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  28.46 
 
 		 158 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3495  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000947375  hitchhiker  0.00194912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2600  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0515  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0814  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.38 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2945  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.77 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000877999  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2463  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.17 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3167  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000318686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.97 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.245577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1987  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.11 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3070  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000697512  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  29.92 
 
 		 177 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2989  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505738  normal  0.32761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.97 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3575  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, putative  32.91 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>