72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2217 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  93.1 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  66.96 
 
 		 230 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  72.49 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  60.26 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  45.95 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.3 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  42.98 
 
 		 287 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  43.36 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  43.36 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  41.48 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  41.05 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  41.05 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.63 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  45.95 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  45.79 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  40.77 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.62 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  40.66 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  41.75 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  41.75 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  40.09 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.92 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  43.24 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.39 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  41.67 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  39.57 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  42.7 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  34.84 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  30.84 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  34.94 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0691  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.59 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1257  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.74 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1132  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.74 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2273  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.34 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01448  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, putative  27.05 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3495  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.36 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000947375  hitchhiker  0.00194912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  24.83 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1263  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.12 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0298141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1899  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  27.55 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1194  putative integral membrane protein  26.12 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0608  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.89 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0780  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.56 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1759  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  26.32 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0247  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0734218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2102  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.22 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.83 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.06 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0896  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  26.06 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1340  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.36 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00208453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  27.59 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2245  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.48 
 
 		 421 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0515  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.61 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4661  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.96 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.141457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1744  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  25.41 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000985614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2517  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.21 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0490  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.61 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3718  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25 
 
 		 260 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000542446  hitchhiker  0.00889644 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0610  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.56 
 
 		 274 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231692  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.03 
 
 		 185 aa  42  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3829  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.47 
 
 		 325 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0515  hypothetical protein  25.57 
 
 		 245 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0539  hypothetical protein  25.57 
 
 		 245 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>