37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1145 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  42.08 
 
 		 267 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.34 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  37.09 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  32.29 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  32.44 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.17 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  29.07 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  34.86 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  37.71 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  31.74 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  30.65 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  31.98 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  33.15 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  30.54 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  34.29 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  32.76 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  33.33 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  33.33 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  32.76 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  32.34 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.29 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  38.29 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  30 
 
 		 266 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  30 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  32.54 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  29.5 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  31.09 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  30.9 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  29.29 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  31.18 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  28.27 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0902  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.46 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 274 aa  41.6  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000985614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>