78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1714 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  100 
 
 
242 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  97.93 
 
 
242 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  87.14 
 
 
241 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  84.17 
 
 
241 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  66.81 
 
 
287 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  65.13 
 
 
270 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  64.88 
 
 
243 aa  315  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  64.71 
 
 
266 aa  315  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  57.87 
 
 
253 aa  280  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  44 
 
 
247 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  45.73 
 
 
244 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.09 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  40 
 
 
244 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.23 
 
 
230 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  41.05 
 
 
232 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.05 
 
 
238 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  41.05 
 
 
238 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  41.26 
 
 
244 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  40.44 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.91 
 
 
244 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  40 
 
 
230 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  41.71 
 
 
236 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  36.76 
 
 
249 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  36.22 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.22 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  41.71 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  39.89 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.07 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.01 
 
 
243 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  36.22 
 
 
267 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  29.69 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  29.95 
 
 
255 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  35.35 
 
 
256 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  33.33 
 
 
236 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0939  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.57 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1987  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.26 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1263  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.06 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0298141  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2011  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.21 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0183  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.01 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0814  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.74 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.68 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1460  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  24.85 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89804  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0470  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.17 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5066  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  30 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.426955  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3072  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.52 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0515  hypothetical protein  25.4 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1790  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  23.84 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0539  hypothetical protein  25.4 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1194  putative integral membrane protein  27.13 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2177  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1844  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0332884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1017  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.15474  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1627  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  24.32 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1049  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2299  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0291884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1117  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0749  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1423  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1278  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1285  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2517  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.25 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0400  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3227  CDP-diacylglycerol--serine O- phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.641842  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0988  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.81 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1650  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2261  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5588  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2284  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1332  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2018  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.688752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  27.56 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1059  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.6 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3217  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.71 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2463  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25.83 
 
 
179 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1525  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25.87 
 
 
267 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1720  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.21 
 
 
270 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.047283  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.61 
 
 
216 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>