36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2842 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  81.59 
 
 		 244 aa  357  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  73.11 
 
 		 244 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  73.64 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  70.29 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  70.29 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  65.35 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  46.64 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  45 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  44 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  44 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  44 
 
 		 242 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  44 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  42.22 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  43.48 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  43.26 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  44.16 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  42.79 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.35 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.48 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  41.48 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.08 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  39 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  39 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.27 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  42.41 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  38.86 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  42.93 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  30.24 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  30.24 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.91 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  27.84 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  35.62 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  32.54 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  29.27 
 
 		 177 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>