62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0272 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  100 
 
 
256 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  68 
 
 
267 aa  301  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  40.34 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  39.82 
 
 
255 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  39.37 
 
 
255 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  33.64 
 
 
234 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  38.05 
 
 
236 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.01 
 
 
254 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  38.05 
 
 
238 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  33.63 
 
 
239 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.63 
 
 
239 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  35.59 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  36.23 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.44 
 
 
243 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  36.41 
 
 
287 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  37.7 
 
 
238 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  34.82 
 
 
266 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.7 
 
 
238 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  35.64 
 
 
241 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  38.02 
 
 
230 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  34.82 
 
 
270 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  41.09 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  34.88 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.86 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  34.47 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  41 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  34.13 
 
 
241 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  37.78 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  39.01 
 
 
244 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  34.75 
 
 
244 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.24 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  37.62 
 
 
243 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  36.76 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  36.12 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  39.18 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6048  Phosphatidylserine synthase-like protein  30.98 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2003  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  33.33 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4721  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.57 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1138  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.23 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0988  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  24.76 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1300  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0011  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  22.62 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.94141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1507  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3875  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.810474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  27.27 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1469  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1575  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1299  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1536  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1338  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1326  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1435  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1987  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.23 
 
 
262 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0939  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.21 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1995  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  27.05 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0117  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  23.97 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000148118  hitchhiker  0.000000000480948 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1194  putative integral membrane protein  22.58 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3072  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1031  hypothetical protein  30.11 
 
 
172 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1029  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.52 
 
 
294 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308197  normal  0.0167262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.02 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2538  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  22.12 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000122847  hitchhiker  0.00117783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>