74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1420 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  84.17 
 
 		 242 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  84.17 
 
 		 242 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  82.16 
 
 		 241 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  68.38 
 
 		 243 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  66.67 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  65.81 
 
 		 287 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  66.24 
 
 		 266 aa  313  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  63.88 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  46.64 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  41.99 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  41.33 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  42.48 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.55 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.3 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.71 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  40 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.81 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  41.12 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  36.76 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  39.06 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.76 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  36.76 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.33 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  30.45 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  30.88 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  40.1 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  39.89 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  29.65 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  35.85 
 
 		 267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.62 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  33.33 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0988  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  30.71 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1987  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0814  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.74 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5066  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  27.59 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.426955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0539  hypothetical protein  26.19 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0515  hypothetical protein  26.19 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0939  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.41 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0470  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.85 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.68 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1525  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  24.4 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2463  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25.86 
 
 		 179 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1790  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  24.5 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1263  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.68 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0298141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1423  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3072  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.58 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1017  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.15474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1332  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1844  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0332884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1117  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0749  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5588  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1327  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.74 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.569353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3227  CDP-diacylglycerol--serine O- phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.641842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1278  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1049  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1285  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0400  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2284  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2261  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1650  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0504  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  24.74 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3217  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.42 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2018  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.688752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2177  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2517  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2299  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.4 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0291884  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1059  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.6 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1627  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  27.16 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>