64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0866 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  99.58 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  79.83 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  68.12 
 
 		 236 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  67.69 
 
 		 238 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  65.35 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  45.98 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  42.5 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  41.85 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  39.38 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  41.3 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  45.4 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  35.53 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  38.42 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.7 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  42.25 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  42.25 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  40.22 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  39 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  39.79 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  36.76 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  36.76 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  37.44 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  36.22 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  38.14 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  39 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  39.57 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  33.63 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  35.81 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  29.79 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  35.19 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  28.94 
 
 		 255 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  31.74 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1867  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.46 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000350259  normal  0.0704883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1059  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.35 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2945  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.06 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000877999  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2517  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.77 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3070  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000697512  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.17 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3575  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, putative  34.18 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3167  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000318686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2989  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505738  normal  0.32761 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1263  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.47 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0298141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2600  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3495  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000947375  hitchhiker  0.00194912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1901  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25.76 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635563  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.77 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0814  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.4 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2224  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  25.76 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.367429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0750  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.98 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.245577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0515  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0400  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1844  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0332884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1285  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1278  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0749  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1117  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1423  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2858  phosphatidylserine synthase-like  30.77 
 
 		 201 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1049  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  26.83 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2073  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase protein  29.27 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>