40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2382 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  100 
 
 
230 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  68.56 
 
 
232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  66.96 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  66.96 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  61.14 
 
 
230 aa  284  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  58.15 
 
 
243 aa  241  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  41.78 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  43.3 
 
 
243 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  43.11 
 
 
287 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  43.11 
 
 
270 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  43.11 
 
 
266 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  40 
 
 
241 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  40.35 
 
 
247 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  41.23 
 
 
242 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  41.23 
 
 
242 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  40.71 
 
 
241 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.67 
 
 
244 aa  164  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  45.88 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  46.77 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.57 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  42.25 
 
 
236 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  41.1 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  40.22 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  40.22 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  39.13 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  39.34 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  42.39 
 
 
254 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  39.91 
 
 
244 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  41.71 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  38.5 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  38.86 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  30.65 
 
 
236 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  34.13 
 
 
255 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  34.13 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.7 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.7 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.25 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.51 
 
 
216 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  28.06 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>