75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3672 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3672  maleate cis-trans isomerase  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2119  Asp/Glu racemase  70.08 
 
 		 261 aa  352  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296834  normal  0.0170584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  67.48 
 
 		 252 aa  338  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  66.12 
 
 		 252 aa  332  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  65.16 
 
 		 252 aa  331  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  64.49 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0831  Asp/Glu racemase  65.15 
 
 		 251 aa  328  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1385  Asp/Glu racemase  61.18 
 
 		 264 aa  318  6e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3577  Asp/Glu/hydantoin racemase  60.16 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  60.49 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  60.49 
 
 		 250 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3942  maleate cis-trans isomerase  60.49 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783757  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  60.16 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1895  Asp/Glu racemase  60.49 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2142  Asp/Glu/hydantoin racemase  59.76 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  59.76 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  59.76 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  59.76 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  60.73 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  59.35 
 
 		 250 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5483  Asp/Glu racemase  57.37 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  58.3 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  60.08 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1852  Asp/Glu/hydantoin racemase  56.68 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3099  Asp/Glu racemase  58.23 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4901  Asp/Glu racemase  57.79 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1552  Asp/Glu/hydantoin racemase  57.32 
 
 		 250 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00579321  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1881  Asp/Glu/hydantoin racemase  56.91 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.650539  normal  0.394704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  56.33 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  50.62 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.61 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  30.04 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.03 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  29.83 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.6 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0302  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.32 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  26.77 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.9 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  26.91 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  24.21 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  26.58 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  25.2 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  23.67 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.3 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.02 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  26.1 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.84 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  27.09 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  23.65 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  23.11 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.69 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  28.8 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  23.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.39 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  27.66 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.02 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  24.28 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  24.49 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  25.47 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.5 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  22.58 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  26.89 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  21.63 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.39 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.39 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  26.89 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  27.35 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  24.3 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.85 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6543  hypothetical protein  26.03 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  23.96 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  25.57 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.92 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.13 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1246  Asp/Glu/hydantoin racemase  20 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>