50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3330 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3330  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  100 
 
 		 385 aa  798    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3331  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  48.41 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000133768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2407  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40 
 
 		 391 aa  282  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2963  hypothetical protein  38.87 
 
 		 412 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0037  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.55 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.44 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  25.48 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  23.74 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  24.1 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  23.55 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  23.11 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  24.81 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3003  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 816 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  23.64 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  23.85 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  25.09 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  24.65 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  22.78 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  24.32 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.29 
 
 		 324 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  23.77 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  22.34 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  22.8 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.98 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  22.76 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  23.17 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  25.82 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  21.54 
 
 		 315 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  22.76 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.76 
 
 		 326 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.69 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  21.94 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  23.85 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  24.51 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  23.55 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  23.35 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.31 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  22.69 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  20.85 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  24.48 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  23.79 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  21.88 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  21.13 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  23.24 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.13 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  21.92 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  20.47 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.5 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  23.29 
 
 		 321 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>