21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2963 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2407  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  86.53 
 
 		 391 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2963  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  846    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3331  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.95 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000133768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3330  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  38.87 
 
 		 385 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0037  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.5 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24.75 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3003  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.38 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  25.68 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  25 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  27.6 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  26.15 
 
 		 292 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  21.67 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  21.34 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  23.23 
 
 		 335 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.66 
 
 		 325 aa  46.6  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  25.29 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  20.83 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  21.13 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  21.22 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>