62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3331 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3331  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  100 
 
 		 386 aa  796    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000133768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3330  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  48.41 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2407  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.91 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2963  hypothetical protein  41.95 
 
 		 412 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0037  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.81 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3003  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.78 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  21.89 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.49 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  25.3 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  20.99 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  25.37 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  22.88 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  22.46 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  24.4 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  22.37 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  22.64 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  22.78 
 
 		 321 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  21.99 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  21.63 
 
 		 335 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.75 
 
 		 323 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  21.81 
 
 		 321 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  21.93 
 
 		 322 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  25.18 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.03 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  22.26 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  25.61 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  22.37 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.19 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  22.49 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.99 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.61 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  24.04 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  23.83 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  24.73 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  21.83 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  21.8 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  22.36 
 
 		 322 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  23.21 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.03 
 
 		 584 aa  46.2  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.4 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  24.23 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.18 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.86 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  26.18 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  18.95 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.78 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.38 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  22.49 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  19.03 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  23.98 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  24.09 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.71 
 
 		 347 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  24.34 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  21.2 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2568  hypothetical protein  32.61 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>