83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4018 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4018  FHA domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0481  FHA domain-containing protein  25.24 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3092  hypothetical protein  22.88 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4519  hypothetical protein  23.75 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  36.89 
 
 
234 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  31.25 
 
 
166 aa  55.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0421  FHA domain-containing protein  21.24 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.349643  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  30.34 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  31.96 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
153 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1115  ATPase  37.88 
 
 
117 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474042  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
1481 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  31.51 
 
 
233 aa  49.3  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  29.29 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  33.75 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  21.83 
 
 
566 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  24.39 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
1493 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  31.37 
 
 
439 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5672  FHA domain containing protein  27.96 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0631654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  31.87 
 
 
456 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  37.66 
 
 
255 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  34.33 
 
 
288 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2610  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
197 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.034303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  38.98 
 
 
152 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  27.16 
 
 
220 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1117  FHA domain-containing protein  28.97 
 
 
116 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0556817  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1317  Forkhead-associated protein  30.77 
 
 
168 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  30.67 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.11 
 
 
890 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  34.43 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  31.08 
 
 
170 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  26.51 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  31.58 
 
 
137 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  32.22 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  32.91 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  28.4 
 
 
145 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  30.38 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  27.38 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  29.25 
 
 
1488 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  26.67 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4593  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.51 
 
 
665 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273908  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  28.95 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0493  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.82 
 
 
1478 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0820  FHA domain-containing protein  30.86 
 
 
193 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27040  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  25.93 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  31.51 
 
 
138 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  32.1 
 
 
408 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  32.84 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  26.88 
 
 
155 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  30.38 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  39.66 
 
 
158 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.58 
 
 
554 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  28.92 
 
 
154 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  27.63 
 
 
206 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  28.41 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  30.34 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  34.25 
 
 
162 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2647  FHA domain containing protein  28.57 
 
 
234 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0083  FHA domain containing protein  28.09 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
174 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.88 
 
 
513 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00240  FHA domain-containing protein  32.88 
 
 
402 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  34.29 
 
 
146 aa  43.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0027  FHA domain containing protein  28.92 
 
 
420 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4708  FHA domain containing protein  30.99 
 
 
173 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  30.14 
 
 
233 aa  43.1  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  27.16 
 
 
211 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  27.16 
 
 
211 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0726  FHA domain containing protein  29.87 
 
 
198 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  27.63 
 
 
206 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  27.71 
 
 
514 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  36 
 
 
137 aa  42.7  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  27.71 
 
 
137 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2047  Forkhead-associated protein  36.67 
 
 
814 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.445057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2647  FHA domain containing protein  27.63 
 
 
206 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3791  FHA domain containing protein  23.4 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000134808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>