10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3092 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3092  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  711    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4018  FHA domain-containing protein  23.4 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0481  FHA domain-containing protein  23.08 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4519  hypothetical protein  23.24 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  39.29 
 
 		 168 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  32.89 
 
 		 166 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  32.61 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0048  FHA domain-containing protein  33.01 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0043  FHA domain-containing protein  33.01 
 
 		 161 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  31 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>